Ответ: Не согласен. В 1/16 играет команда высшей лиги. Кто соперник (первая, вторая, а бывало - и третья лига) - неважно. В этих матчах забивают либо за команду высшего уровня, либо команде высшего уровня. И играют за обладание кубком.
Моё предположение в том, что в переходных матчах играет уже не совсем команда высшей лиги, высшего уровня. Играют за то, чтобы оказаться на этом высшем уровне.

Ответ: Противоречия нет. Шуков играл за олимпийскую сборную, т.е. имел российское футбольное гражданство (и обычное гражданство, соответственно, тоже). То, что потом он от него отказался (как следует из его интервью СЭ в 2005-м: http://www.sport-express.ru/newspaper/2005-06-09/3_5/), не означает, что его следует исключить из рейтинга. Это просто продолжение длинного разговора про смену гражданства и т.п. (а в данном случае даже смены футбольного гражданства не было).
Что касается Нидергауса, то это уникальный (для России, во всяком случае) футболист, который сначала в 1992-м сыграл три товарищеских матча (и забил один мяч) за Казахстан, затем в 1994-м провёл один - товарищеский же - матч за Россию, а в 2000-м опять появился на одну игру в составе Казахстана, и снова товарищескую. В официальных матчах за сборные, таким образом, не играл. Я долго думал, как трактовать такую головокружительную карьеру, и в итоге принял решение, что товарищеский матч за Россию - важнее товарищеских матчей за Казахстан (пусть даже их было 4). Не спрашивайте, почему :). И в списке легионеров-бомбардиров он не учитывается.

Ответ: Действительно... Elvir должно передаваться как Элвир, без вариантов.
Но даже на оф.сайте ЦСКА он Элвер. Бывает...

Ответ: Пока - не считаются. Подвести под это логическую базу затрудняюсь. Ну, возможно, неявно предполагается, что это турнир уровня первой лиги, а не высшей. Т.е. участники, которые из высшей лиги, уже как бы вылетели. А участники из первой - ещё не вышли в высшую. И вот теперь соревнуются, чтобы перейти.
Разумеется, обратная трактовка тоже допустима, но мне кажется натянутой: я могу допустить, что участники переходных матчей из вышки уже вылетели, а вот то, что участники из первой лиги уже поднялись (и теперь играют переходный турнир, чтобы остаться) - не могу.

Ответ: 1. Да, чем-то похоже на гол Широкова Ирландии (http://www.youtube.com/watch?v=2KVt6iFna0c).
2...
3. Внял вашей настойчивости, пересоздал страницы, благодарю за терпение.

Ответ: Ну, у нас с вами традиционные несовпадения в толкованиях автоголов. Мне не близок "англо-итальянский" подход, при котором чуть ли не любое касание обороняющегося (за исключением вратаря) отбирает гол у атакующего. Я уверен, что защитник решает ту же задачу, что и вратарь, и в случае со вторым голом Динамо это было очевидно: там мяч нашёл защитника почти на линии ворот, в которые попадал по-любому. Третий гол - чуть менее очевидный, там защитник скорее накрывает удар, а не выбивает из ворот, но я по-прежнему формального критерия придумать не могу. Как далеко нужно "отодвинуть" защитника от ворот и приблизить к нападающему, чтобы рикошет уже считался значимым и "переписывал" гол на защитника? Мне, как и раньше, представляется, что исходить нужно из действий не обороны, а атаки, и учитывать намерение. Был удар по воротам? да. Мяч был направлен в створ? Вероятно. Значит, гол забил нападающий.

Ответ: Как мне представляется, 600 - именно по официальному реестру РФС (хотя на их сайте найти полного списка не удаётся), он в 90-е годы был откорректирован относительно прежних лет и с тех пор задним числом не менялся. Поглядел список eloratings (http://eloratings.net/Russia.htm): много матчей, которые нами не считаются официальными (например, самый первый с Англией, матчи РСФСР-1923, матчи 1930-х гг. с Турцией, предолимпийские матчи 1952, отборочные матчи Олимпиад в 1960-70 гг.). В то же время отсутствуют некоторые матчи, которые у нас входят в реестр (например, за третье место в Монреале-1976). Полностью список не сверял, конечно.
На замечательном сайте Александра Кашинцева о сборной нумерация также ведётся согласно официальному реестру, и там тоже 600 (http://rusteam.permian.ru/history/2011.html).